MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 megaplasmid

Total Repeats: 3998

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015851	GC	3	6	30226	30231	0 %	0 %	50 %	50 %	340783655
502	NC_015851	CG	3	6	30256	30261	0 %	0 %	50 %	50 %	340783655
503	NC_015851	TG	3	6	30288	30293	0 %	50 %	50 %	0 %	340783655
504	NC_015851	TCTGT	2	10	30334	30343	0 %	60 %	20 %	20 %	340783655
505	NC_015851	GCA	2	6	30349	30354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783655
506	NC_015851	GCG	2	6	30387	30392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783655
507	NC_015851	TGC	2	6	30527	30532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783655
508	NC_015851	AGT	2	6	30546	30551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783655
509	NC_015851	CAC	2	6	30560	30565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783655
510	NC_015851	ATA	2	6	30603	30608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340783655
511	NC_015851	TGC	2	6	30774	30779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783655
512	NC_015851	CGA	2	6	30834	30839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783655
513	NC_015851	CGG	2	6	30862	30867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783655
514	NC_015851	TTC	2	6	30917	30922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783655
515	NC_015851	GC	3	6	30981	30986	0 %	0 %	50 %	50 %	340783655
516	NC_015851	ATAA	2	8	31044	31051	75 %	25 %	0 %	0 %	340783655
517	NC_015851	GAT	2	6	31212	31217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783656
518	NC_015851	CGG	2	6	31229	31234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783656
519	NC_015851	ACGA	2	8	31237	31244	50 %	0 %	25 %	25 %	340783656
520	NC_015851	AGA	2	6	31301	31306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783656
521	NC_015851	GGT	2	6	31314	31319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783656
522	NC_015851	AGC	2	6	31370	31375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783656
523	NC_015851	GGGC	2	8	31380	31387	0 %	0 %	75 %	25 %	340783656
524	NC_015851	TCC	2	6	31389	31394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783656
525	NC_015851	TGG	2	6	31424	31429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783656
526	NC_015851	CTG	2	6	31474	31479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783656
527	NC_015851	TCG	2	6	31482	31487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783656
528	NC_015851	ATCGG	2	10	31562	31571	20 %	20 %	40 %	20 %	340783656
529	NC_015851	GC	3	6	31621	31626	0 %	0 %	50 %	50 %	340783656
530	NC_015851	TCG	2	6	31652	31657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783656
531	NC_015851	AGC	2	6	31682	31687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783656
532	NC_015851	AAG	2	6	31789	31794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783656
533	NC_015851	ATTC	2	8	31851	31858	25 %	50 %	0 %	25 %	340783656
534	NC_015851	GT	3	6	31881	31886	0 %	50 %	50 %	0 %	340783656
535	NC_015851	GCG	2	6	31909	31914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783656
536	NC_015851	GGA	2	6	31977	31982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783656
537	NC_015851	CTGC	2	8	32048	32055	0 %	25 %	25 %	50 %	340783656
538	NC_015851	GCG	2	6	32061	32066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783656
539	NC_015851	GTGC	2	8	32086	32093	0 %	25 %	50 %	25 %	340783656
540	NC_015851	GCC	2	6	32113	32118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783656
541	NC_015851	GGT	2	6	32131	32136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783656
542	NC_015851	ATG	2	6	32185	32190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783656
543	NC_015851	ATT	2	6	32859	32864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340783657
544	NC_015851	CCG	2	6	32872	32877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783657
545	NC_015851	ACG	2	6	32879	32884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783657
546	NC_015851	GCT	2	6	32988	32993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783657
547	NC_015851	CCA	3	9	33060	33068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783657
548	NC_015851	AACC	2	8	33148	33155	50 %	0 %	0 %	50 %	340783657
549	NC_015851	CCCG	2	8	33187	33194	0 %	0 %	25 %	75 %	340783657
550	NC_015851	GGA	2	6	33247	33252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783657
551	NC_015851	CGC	2	6	33286	33291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783657
552	NC_015851	TCT	2	6	33306	33311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783657
553	NC_015851	CCA	2	6	33657	33662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783658
554	NC_015851	CGT	2	6	33679	33684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783658
555	NC_015851	TC	3	6	33777	33782	0 %	50 %	0 %	50 %	340783658
556	NC_015851	GATG	2	8	33879	33886	25 %	25 %	50 %	0 %	340783658
557	NC_015851	TGG	2	6	33958	33963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783658
558	NC_015851	GC	3	6	33986	33991	0 %	0 %	50 %	50 %	340783658
559	NC_015851	CGA	2	6	34323	34328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783659
560	NC_015851	AAG	2	6	34357	34362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783659
561	NC_015851	CGC	2	6	34391	34396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783659
562	NC_015851	TTC	2	6	34435	34440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783659
563	NC_015851	GAG	2	6	34495	34500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783659
564	NC_015851	AGGA	2	8	34517	34524	50 %	0 %	50 %	0 %	340783659
565	NC_015851	GC	3	6	34528	34533	0 %	0 %	50 %	50 %	340783659
566	NC_015851	GGT	2	6	34534	34539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783659
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568	NC_015851	GGA	2	6	34584	34589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783659
569	NC_015851	GCG	2	6	34648	34653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783659
570	NC_015851	CTG	2	6	34654	34659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783659
571	NC_015851	CTG	2	6	34666	34671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783659
572	NC_015851	GC	3	6	34683	34688	0 %	0 %	50 %	50 %	340783659
573	NC_015851	ATC	2	6	34750	34755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783659
574	NC_015851	GTC	2	6	34912	34917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783659
575	NC_015851	CCG	2	6	34982	34987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783659
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578	NC_015851	GC	3	6	35770	35775	0 %	0 %	50 %	50 %	340783660
579	NC_015851	CGCCC	2	10	35867	35876	0 %	0 %	20 %	80 %	340783660
580	NC_015851	CGC	2	6	35917	35922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783660
581	NC_015851	TGG	2	6	35958	35963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783660
582	NC_015851	AAG	2	6	36001	36006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783661
583	NC_015851	CGT	3	9	36016	36024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783661
584	NC_015851	GAA	2	6	36031	36036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783661
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586	NC_015851	GCGG	2	8	36084	36091	0 %	0 %	75 %	25 %	340783661
587	NC_015851	AAG	2	6	36115	36120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783661
588	NC_015851	CAT	2	6	36231	36236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783661
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590	NC_015851	ACG	2	6	36482	36487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783662
591	NC_015851	TGG	2	6	36521	36526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783662
592	NC_015851	CTT	2	6	36531	36536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783662
593	NC_015851	GGT	2	6	36657	36662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783662
594	NC_015851	CCG	2	6	36669	36674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783662
595	NC_015851	GGT	2	6	36675	36680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783662
596	NC_015851	GC	3	6	37054	37059	0 %	0 %	50 %	50 %	340783663
597	NC_015851	GCA	3	9	37107	37115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783663
598	NC_015851	CGA	2	6	37310	37315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783664
599	NC_015851	GCC	2	6	37347	37352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783664
600	NC_015851	GCT	2	6	37386	37391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783664
601	NC_015851	CCA	2	6	37539	37544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783664
602	NC_015851	GCCCGC	2	12	37837	37848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783665
603	NC_015851	CCT	2	6	37862	37867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783665
604	NC_015851	TG	3	6	38008	38013	0 %	50 %	50 %	0 %	340783665
605	NC_015851	CCG	2	6	38069	38074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783665
606	NC_015851	CAG	3	9	38091	38099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783665
607	NC_015851	TTC	2	6	38157	38162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783665
608	NC_015851	AGC	2	6	38251	38256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783665
609	NC_015851	CG	3	6	38274	38279	0 %	0 %	50 %	50 %	340783665
610	NC_015851	TTC	2	6	38441	38446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783666
611	NC_015851	CGGG	2	8	38449	38456	0 %	0 %	75 %	25 %	340783666
612	NC_015851	GATC	2	8	38458	38465	25 %	25 %	25 %	25 %	340783666
613	NC_015851	CA	3	6	38523	38528	50 %	0 %	0 %	50 %	340783666
614	NC_015851	CTT	3	9	38627	38635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783666
615	NC_015851	CCT	2	6	38669	38674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783667
616	NC_015851	A	6	6	38692	38697	100 %	0 %	0 %	0 %	340783667
617	NC_015851	C	6	6	38783	38788	0 %	0 %	0 %	100 %	340783667
618	NC_015851	CA	3	6	38802	38807	50 %	0 %	0 %	50 %	340783667
619	NC_015851	CCAG	2	8	38844	38851	25 %	0 %	25 %	50 %	340783667
620	NC_015851	GCG	2	6	38969	38974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783667
621	NC_015851	GCGGTA	2	12	38976	38987	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	340783667
622	NC_015851	AGG	2	6	39008	39013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783667
623	NC_015851	AGCACC	2	12	39095	39106	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	340783667
624	NC_015851	AGC	2	6	39107	39112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783667
625	NC_015851	CCAA	2	8	39151	39158	50 %	0 %	0 %	50 %	340783667
626	NC_015851	GCC	2	6	39176	39181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783667
627	NC_015851	GCG	2	6	39188	39193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783667
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629	NC_015851	ACA	2	6	39328	39333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783668
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